Неки трајни маркери су водоотпорни, углавном у зависности од мастила и материјала кућишта оловке.
Генерално, маркери формулисани специјалним мастилима на бази уља имају бољу водоотпорност. Чак и када се користи у влажном или кишном окружењу, писани текст неће бити лако разблажен или замућен водом. Због тога је за људе који имају потребу да користе маркере на отвореном или у влажном окружењу, веома је важно одабрати маркере који су водоотпорни.
Поред тога, материјал кућишта оловке такође може утицати на водоотпорност маркера. Оклоп неких маркера је направљен од полимерног материјала, који има одређена водоотпорна својства и може додатно заштитити мастило од влаге.
Међутим, нису сви трајни маркери водоотпорни. Неки маркери са мастилима на бази воде могу изгледати избледели или замућени под дејством воде. Због тога, приликом куповине маркера, потрошачи треба да изаберу маркер са водоотпорном функцијом у складу са својим потребама, и пажљиво прегледају опис производа или замоле продавача да потврди његову водоотпорност.
